第6集:2001年（219~262）
219（235~238） 被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德★ S/K（注：前半集“钟楼对决”根据《》漫画第4卷“漆黑之星”篇改编，并非改编自《名侦探柯南》漫画） 220（239） 满口谎言的委托人（前篇） 221（240） 满口谎言的委托人（后篇） X 222（241） 人鱼失踪记（事件篇） X 223（242） 人鱼失踪记（推理篇） X 224（243） 人鱼失踪记（解决篇） X 225（244） 生意兴隆的秘密◆ 226（245） 格斗游戏的陷阱（前篇） F 227（246） 格斗游戏的陷阱（后篇） F 228（247） 暗藏杀机的陶艺教室（前篇） 229（248） 暗藏杀机的陶艺教室（后篇） 230（249） 神秘的乘客（前篇） B/F 231（250） 神秘的乘客（后篇） B/F 232（251） 公寓坠楼事件◆ 233（252） 未消失的证据（前篇） 234（253） 未消失的证据（后篇） 235（254） 地下酒窖密室◆ 236（255） 南纪白滨的推理之旅（前篇）◆ 237（256） 南纪白滨的推理之旅（后篇）◆ 238（257） 大阪3K事件（前篇） X 239（258） 大阪3K事件（后篇） X 240（259） 新干线护送事件（前篇） X 241（260） 新干线护送事件（后篇） 242（261） 元太的灾难 243（262） 毛利小五郎的冒充者（前篇） 244（263） 毛利小五郎的冒充者（后篇） 245（264） 向日葵馆的枪声◆ 246（265） 陷入网中的谜团（前篇） 247（266） 陷入网中的谜团（后篇） 248（267） 疗养森林的不在场证明◆ 249（268） 偶像们的秘密（前篇） 250（269） 偶像们的秘密（后篇） 251（270） OK牧场的悲剧◆ 252（271） 画中的绑匪◆ 253（272） 本厅刑事恋爱物语4（前篇） 254（273） 本厅刑事恋爱物语4（后篇） F 255（274） 松江玉造连句大战十四回合（前篇）◆ 256（275） 松江玉造连句大战十四回合（后篇）◆ 257（276） 匪夷所思的天谴◆ 258（277） 来自芝加哥的男子（前篇） F 259（278） 来自芝加哥的男子（后篇） F 260（279） 摇晃的餐厅◆ 261（280） 雪夜的恐怖传说（前篇）◆ 262（281） 雪夜的恐怖传说（后篇）◆
